Genetics of Phytobacterial Infections
María José Soto Misffut (PI)
Professor
Soil Microbiology and Symbiotic Systems, Estación Experimental del Zaidín, CSIC, Granada, Spain
PHONE NUMBER
+34-958-526477 (office); +34-958-526524 (lab)
Other group members
Virginia Cuéllar Maldonado
Technician
Lydia Mª Bernabéu Roda
Postdoc
Cristina Carvia Hermoso
PhD Student
Research lines
- Identification of bacterial genes and chemical signals crucial for the colonization of plants
- Volatile compounds emitted by Rhizobium: function, mechanism of action and synthesis
- Molecular bases of surface motility in Rhizobium
- Effect of Rhizobium metabolites on soil microbial populations and plant microbiota
Representative publications
- Contreras-Moreno FJ, Moraleda-Muñoz A, Marcos-Torres FJ, Cuéllar V, Soto MJ, Pérez J, Muñoz-Dorado J (2024) Siderophores and competition for iron govern myxobacterial predation dynamics. ISME J 18(1): wrae077 (doi: 10.1093/ismejo/wrae077).
- Carvia-Hermoso C, Cuéllar V, Bernabéu-Roda LM, van Dillewijn P, Soto MJ (2024) Sinorhizobium meliloti GR4 produces chromosomal- and pSymA-encoded Type IVc Pili that influence the interaction with alfalfa plants. Plants 13: 628 (doi: 10.3390/plants13050628).
- Soto MJ, Pérez J, Muñoz-Dorado J, Contreras-Moreno FJ, Moraleda-Muñoz A (2023) Transcriptomic response of Sinorhizobium meliloti to the predatory attack of Myxococcus xanthus. Front Microbiol 14: 1213659 (doi: 10.3389/fmicb.2023.1213659).
- Brito-Santana P, Duque-Pedraza JJ, Bernabéu-Roda LM, Carvia-Hermoso C, Cuéllar V, Fuentes-Romero F, Acosta-Jurado S, Vinardell JM, Soto MJ (2023) Sinorhizobium meliloti DnaJ is required for surface motility, stress tolerance, and for efficient nodulation and symbiotic nitrogen fixation. Int J Mol Sci 24: 5848 (doi: 10.3390/ijms24065848).
- Soto MJ, López-Lara IM, Geiger O, Romero-Puertas MC, van Dillewijn P (2021) Rhizobial volatiles: potential new players in the complex interkingdom signaling with legumes. Front Plant Sci 12: 698912 (doi: 10.3389/fpls.2021.698912).
- Pech-Canul A, Rivera-Hernández G, Nogales J, Geiger O, Soto MJ, and López-Lara IM (2020) Role of Sinorhizobium meliloti and Escherichia coli long-chain acyl-CoA synthetase FadD in long-term survival. Microorganisms 8: 470 (doi: 10.3390/microorganisms 8040470).
- Crespo-Rivas JC, Navarro-Gómez P, Alias-Villegas C, Shi J, Zhen T, Niu Y, Cuéllar V, Moreno J, Cubo T, Vinardell JM, Ruiz-Sainz JE, Acosta-Jurado S, Soto MJ (2019) Sinorhizobium fredii HH103 RirA is required for oxidative stress resistance and efficient symbiosis with soybean. Int J Mol Sci 20: (doi: 10.3390/ijms20030787).
- López-Lara I.M, Nogales J, Pech-Canul A, Calatrava-Morales N, Bernabéu-Roda LM, Cuéllar V, Durán P, Olivares J, Alvarez L, Palenzuela-Bretones D, Romero, M, Heeb S, Cámara M, Geiger O, Soto MJ (2018) 2-Tridecanone impacts surface-associated bacterial behaviours and hinders plant-bacteria interactions. Environ Microbiol 20: 2049-2065.
- Calatrava-Morales N, Nogales J, Ameztoy K, van Steenbergen B, Soto MJ (2017) The NtrY/NtrX system of Sinorhizobium meliloti GR4 regulates motility, EPS I production, and nitrogen metabolism but is dispensable for symbiotic nitrogen fixation. Mol Plant-Microbe Interact 30: 566-577.
- Amaya-Gómez CV, Hirsch AM, Soto MJ (2015) Biofilm formation assessment in Sinorhizobium meliloti reveals interlinked control with surface motility. BMC Microbiol 15: 58 (doi: 10.1186/s12866-015-0390-z).
Grants
- Soto MJ (IP), van Dillewijn P, López-Lara IM, Geiger O (2022-2025) RHIZOVOLOMIC. Descifrando el volatiloma de Rhizobium y las bases moleculares de su emisión y actividad infoquímica. Ministerio de Ciencia e Innovación. PID2021-123540NB-I00.
- López-Lara IM (IP), Farias-Rico JA, Geiger O, Soto MJ (2025-2027) Actividades de Sinorhizobium meliloti implicadas en cambios lipídicos frente a variaciones ambientales. Programa de Apoyo a Proyectos de Investigación e Innovación Tecnológica (PAPIIT), UNAM, Nº de proyecto IN221525.
- Lefebvre B, Schneider C (IPs) (2023-2027) ROOT-BENEFIT. Beneficial root-associated microorganisms for a more sustainable agriculture. European Cooperation in Science and Technology e-COST Action CA22142.
- Soto MJ (IP), van Dillewijn P, López-Lara IM, Geiger O (2022-2025) Descifrando el volatiloma de Rhizobium y las bases moleculares de su emisión y actividad infoquímica. Ministerio de Ciencia e Innovación. PID2021-123540NB-I00.
- Soto MJ (IP), Romero-Puertas MC, van Dillewijn P (2021-2023) Efectos del volatiloma de Rhizobium en plantas: Crecimiento, resistencia a estreses y microbiota asociada. Junta de Andalucía Proyectos Frontera PY20_00225.
Patents
- Soto Misffut MJ, Nogales Díaz J, Olivares Pascual J, Sanjuán Pinilla J. Método para prevenir y/o controlar infecciones bacterianas. Referencia P201231248. Presentada 1 agosto 2012. PCT/ES2013/070570. Fecha presentación: 31 julio 2013. Número de publicación WO2014020224 A1 Fecha de publicación 6 Feb 2014.
Relevant methods
- Bacterial genetics
- Bacterial surface mobility assays
- Transcriptomic analysis and real-time PCR
- Symbiotic colonisation, infectivity and competitiveness assays
- Analysis of bacterial volatiles and lipid compounds
- Analysis of bacterial structures: flagella and pili
- Protein purification
- Metagenomic analysis
Collaborations with other national and international research groups
- José Muñoz-Dorado, Juana Pérez, Aurelio Moraleda-Muñoz (Dpto de Microbiología, Universidad de Granada)
- José María Vinardell, José Enrique Ruiz-Sainz, María Rosario Espuny (Dpto de Microbiología, Universidad de Sevilla)
- María C. Romero Puertas (Dpto. de Bioquímica, Biología Celular y Molecular de Plantas, EEZ-CSIC, Granada)
- Javier Pozueta (Instituto de Hortofruticultura Subtropical y Mediterránea “La Mayora”, UMA-CSIC, Málaga)
- Isabel Mª López-Lara, Otto Geiger (Centro de Ciencias Genómicas de la Universidad Nacional Autónoma de Méjico UNAM, Méjico)
- Anke Becker, Elizaveta Krol (SYNMIKRO, Centro de Microbiología Sintética, Marburg, Alemania)
- Pieter van Dillewijn (Dpto. de Biotecnología y Protección Ambiental, EEZ-CSIC, España)
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